稅務(wù)機(jī)關(guān)對(duì)電子商務(wù)實(shí)施檢查困難
　　1、電子商務(wù)使傳統(tǒng)的稅收稽查陷入窘境
　　在電子商務(wù)交易的條件下，隨著交易代理人、批發(fā)商、零售商的消失，產(chǎn)品直接提供給消費(fèi)者，整個(gè)商品的選擇、訂購(gòu)、支付、交付都在網(wǎng)上完成，稅務(wù)機(jī)關(guān)從代理人、批發(fā)商、零售商等課稅點(diǎn)課稅，變?yōu)橹苯酉蛳M(fèi)者課稅。同時(shí)，企業(yè)之間的業(yè)務(wù)往來、利潤(rùn)轉(zhuǎn)移也更加容易。電子商務(wù)還可以輕易改變營(yíng)業(yè)地點(diǎn)，其流動(dòng)性與隱蔽性造成稅務(wù)稽查的難度加大。
　　2、課稅憑證的電子化加大了稅收稽查的難度
　　傳統(tǒng)的稅收稽查是建立在有形的憑證、賬冊(cè)和各種報(bào)表的基礎(chǔ)上，通過對(duì)其有效性、真實(shí)性、邏輯性和合法性等的審核，達(dá)到管理和稽查的目的。而電子商務(wù)的各種報(bào)表和憑證，都是以電子憑證的形式出現(xiàn)和傳遞的，而且電子憑證可以輕易修改、刪除而不留痕跡和線索，無(wú)原始憑證可言，使得傳統(tǒng)的稅收管理和稽查失去了直接的憑證和信息，變得很被動(dòng)。另外，隨著計(jì)算機(jī)加密技術(shù)的發(fā)展，納稅人可以用超級(jí)密碼和用戶名雙重保護(hù)來隱藏有關(guān)信息，使稅務(wù)機(jī)關(guān)收集資料很困難。
　　3、貨幣流量的不可見性增加了稅務(wù)檢查難度
　　電子貨幣和電子銀行的出現(xiàn)使紙質(zhì)憑證不復(fù)存在，電子商務(wù)交易過程中，發(fā)票、賬簿等在計(jì)算機(jī)網(wǎng)絡(luò)中均可以電子形式填制，且能修改，不留任何痕跡，而且購(gòu)銷雙方也可通過交易密碼掩藏交易信息，并用非記賬的電子貨幣完成付款業(yè)務(wù)。此外，在網(wǎng)上貿(mào)易中已經(jīng)開始出現(xiàn)在避稅港開設(shè)聯(lián)機(jī)銀行為交易方提供“稅收保護(hù)”的現(xiàn)象，這使得稅務(wù)機(jī)關(guān)難以獲取交易價(jià)格及款項(xiàng)支付信息，無(wú)法對(duì)交易人的銀行賬目進(jìn)行經(jīng)常性檢查。稅務(wù)機(jī)關(guān)不僅難以掌握交易雙方的具體情況，而且無(wú)法通過對(duì)國(guó)內(nèi)銀行實(shí)施經(jīng)常性檢查來監(jiān)控貨幣流量，從而喪失了貨幣監(jiān)控能力和對(duì)逃稅者的威懾力。
　　電子商務(wù)使得稅制要素難以確認(rèn)
　　1、納稅人的身份難以確認(rèn)
　　在電子商務(wù)條件下，無(wú)紙化的網(wǎng)上交易使稅務(wù)機(jī)關(guān)無(wú)法得知進(jìn)行網(wǎng)上交易的是誰(shuí)，同時(shí)，因特網(wǎng)網(wǎng)址與所有者身份并無(wú)必然聯(lián)系，無(wú)法提供有關(guān)所有者的真實(shí)信息，不易確認(rèn)納稅人的位置。
　　2、征稅對(duì)象的性質(zhì)和數(shù)量難以確定
　　電子商務(wù)征稅對(duì)象以信息流為主，有形商品和服務(wù)的界限變得模糊，稅務(wù)機(jī)關(guān)難以掌握交易信息以及交易金額，即便是掌握了數(shù)字化信息的內(nèi)容，也難以確定交易的類別。同時(shí)，因?yàn)闆]有物流，稅務(wù)機(jī)關(guān)難以掌握有關(guān)信息，導(dǎo)致稅收流失。如果是國(guó)外數(shù)字化商品銷售給國(guó)內(nèi)，還會(huì)導(dǎo)致關(guān)稅的流失。
　　3、電子商務(wù)納稅義務(wù)發(fā)生時(shí)間難以認(rèn)定
　　在電子商務(wù)條件下，無(wú)紙化的網(wǎng)上交易使稅務(wù)機(jī)關(guān)無(wú)法得知網(wǎng)上交易在什么時(shí)間發(fā)出商品、收到貨款，無(wú)從掌握稅收情況，無(wú)法對(duì)企業(yè)進(jìn)行日常稽查，稅收征管的鏈條難以連接。
　　國(guó)際稅收管轄權(quán)的沖突加劇
　　1、電子商務(wù)的發(fā)展弱化了來源地稅收管轄權(quán)
　　在電子商務(wù)中，由于交易的數(shù)字化、虛擬化、隱匿化和支付方式的電子化，交易場(chǎng)所、產(chǎn)品和服務(wù)的提供和使用難以判斷，使所得來源稅收管轄權(quán)失效。外國(guó)企業(yè)利用互聯(lián)網(wǎng)在一國(guó)開展貿(mào)易活動(dòng)時(shí)，常常只需裝有事先核準(zhǔn)軟件的智能服務(wù)器便可買賣數(shù)字化產(chǎn)品，服務(wù)器的營(yíng)業(yè)行為很難被分類和統(tǒng)計(jì)，商品被誰(shuí)買賣也很難認(rèn)定。加之互聯(lián)網(wǎng)的出現(xiàn)，使得服務(wù)也突破了地域的限制，因此，電子商務(wù)使得各國(guó)對(duì)于收入來源地的判斷發(fā)生了爭(zhēng)議。
　　2、居民（公民）稅收管轄權(quán)也受到了嚴(yán)重的沖擊
　　現(xiàn)行稅制一般都以有無(wú)“住所”、是否“管理中心”或“控制中心”作為納稅人居民身份的判定標(biāo)準(zhǔn)。然而，電子商務(wù)超越了時(shí)空的限制，促使國(guó)際貿(mào)易一體化，動(dòng)搖了“住所”、“常設(shè)機(jī)構(gòu)”的概念，造成了納稅主體的多元化、模糊化和邊緣化。隨著電子商務(wù)的出現(xiàn)，國(guó)際貿(mào)易的一體化以及各種先進(jìn)技術(shù)手段的廣泛運(yùn)用，企業(yè)的管理控制中心可能存在于任何國(guó)家。稅務(wù)機(jī)關(guān)將難以根據(jù)屬人原則對(duì)企業(yè)征收所得稅，居民稅收管轄權(quán)也形同虛設(shè)

　互聯(lián)網(wǎng)上的跨國(guó)交易加大了征管信息獲取的難度
　　國(guó)際互聯(lián)網(wǎng)潛力最大的領(lǐng)域之一就是跨國(guó)交易，而任意一個(gè)跨國(guó)交易人都會(huì)期望將其成本降低至與國(guó)內(nèi)交易相當(dāng)?shù)某潭龋鹑诜?wù)是滿足其愿望的必要條件。為了刺激網(wǎng)上交易的發(fā)展，某些在避稅地區(qū)開設(shè)的聯(lián)機(jī)銀行開始為互聯(lián)網(wǎng)交易提供完全的“稅收保護(hù)”。眾所周知，國(guó)內(nèi)銀行是目前稅務(wù)當(dāng)局最重要的信息來源，稅務(wù)機(jī)關(guān)可通過查閱銀行賬目得到納稅人的有關(guān)信息，判斷其申報(bào)的情況是否屬實(shí)。這樣就為稅收提供了一種監(jiān)督機(jī)制，對(duì)于潛在的逃稅者有一種威懾作用。如果信息源變?yōu)樵O(shè)在他國(guó)的聯(lián)機(jī)銀行，這種監(jiān)督制約機(jī)制就會(huì)大打折扣，逃避稅收也就可能成為現(xiàn)實(shí)。另外，隨著計(jì)算機(jī)加密技術(shù)的發(fā)展，納稅人可以用超級(jí)密碼和用戶雙重保護(hù)來隱藏有關(guān)信息，從而加大了稅務(wù)機(jī)關(guān)獲取信息的難度。